Авторы модели двойной спирали ДНК Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик. Фото с сайта state.gov

Расшифрован геном "отца" двойной спирали ДНК

Комментарии Это загадочное слово "ДНК" 17.04.2008 Как прочесть 60 миллиардов букв за один день

Исследователям удалось "прочитать" шесть миллиардов нуклеотидов за два месяца. На весь проект по секвенированию генома Джеймса Уотсона они потратили менее полутора миллионов долларов. Для сравнения, проект "Геном человека" длился в общей сложности 15 лет и обошелся почти в три миллиарда долларов. Секвенирование генома Крейна Вентера - весьма неоднозначной фигуры в научном мире - обошлось в сто миллионов долларов.

Одной из технологических особенностей нового метода секвенирования ДНК является использование существенно более коротких отрезков ДНК для непосредственного "прочтения", чем использовали авторы "Генома человека". Если при реализации проекта "Геном человека" для секвенирования брали короткие участки длиной от 500 до 1000 нуклеотидов, то новый подход предполагает разрезание хромосом на куски, длина которых не превышает 250 нуклеотидов.

ДНК человека упакована в хромосомы, каждая из которых содержит сотни тысяч нуклеотидов. Для того чтобы определить нуклеотидный состав хромосом, их разрезают на куски, которые "прочитывают" отдельно. Каждый из кусков частично перекрывается с соседним. Используя перекрывающиеся участки, полученные отрезки "текста" выстраивают по порядку и в итоге получают последовательность целой хромосомы.

У этого метода существует недостаток: с его помощью трудно восстановить точную последовательность ДНК в местах, богатых повторами. Имея только множество коротких (и из-за повторов почти одинаковых) секвенированных последовательностей, невозможно точно определить, сколько именно повторов находится в этом участке хромосомы. Использование новой технологии с более короткими фрагментами для секвенирования создает дополнительные трудности при выстраивании последовательности целой хромосомы.

Многие ученые, в том числе, Крейг Вентер, благодаря которому проект "Геном человека" был завершен на пять лет раньше намеченного срока, считают, что недостаток новой технологии может помешать ее повсеместному применению.

Ссылки по теме
- The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequencing – Nature, 17.04.2008
- James Watson's genome sequenced at high speed – Nature News, 16.04.2008
- В Китае начали расшифровывать геном большой панды - Lenta.ru, 07.03.2008
- Обвиненный в расизме Нобелевский лауреат оказался негром - Lenta.ru, 10.12.2007
- Обвиненного в расизме Нобелевского лауреата с почетом выпроводили на пенсию - Lenta.ru, 25.10.2007
- Британцы обвинили Нобелевского лауреата в расизме - Lenta.ru, 17.10.2007
- Открыватель двойной спирали ДНК получил свой геном в подарок - Lenta.ru, 01.06.2007
- Ученые частично расшифровали геном неандертальца - Lenta.ru, 16.11.2006
- Полностью расшифрован геном человека - Mednovosti.ru, 26.06.2000

Сайты по теме
- Биография Джеймся Уотсона на сайте Нобелевской премии