Скриншот главной страницы базы данных WikiPathways

Биохимические пути привели в Википедию

Группа биоинформатиков, создавшая базу данных WikiPathways, использовала стандартную программную часть Википедии и специально разработанные алгоритмы для "рисования" моделей биохимических путей. Поиск в WikiPathways можно вести по названию того или иного биохимического пути, названию гена или белка или ключевым словам.

Как и в Википедии, зарегистрированные пользователи могут редактировать контент, добавлять к нему информацию или создавать новые страницы.

Это не первый биоинформатический инструмент, созданный разработчиками WikiPathways. В 2001 году они создали программу Gene Map Annotator and Pathway Profiler (GenMAPP), которая позволяла вычленять основные направления в сложных биохимических путях. Программа активно использовалась, однако пользователи редко посылали созданные с использованием их данных схемы обратно. Поэтому было принято решение создать базу по принципу Википедии, которая предусматривает постоянное увеличение количества содержащейся информации самими пользователями.

В последнее время формат Википедии стал очень популярен среди биоинформатиков. Так, несколько месяцев назад была создана база WikiGene, содержащая информацию о генах человека. Принцип Википедии используется также в базе Protein Data Bank Wiki - "хранилище" трехмерных структур молекул белков и нуклеиновых кислот) и еще нескольких менее популярных базах.

Ссылки по теме
- Пользователи Википедии будут редактировать генетическую информацию - Lenta.ru, 08.07.2008
- Ученые создали базу данных всех живых существ Земли - Lenta.ru, 26.02.2008

Сайты по теме
- База данных биохимических путей WikiPathways
- База данных трехмерных структур молекул белков и нуклеиновых кислот Protein Data Bank Wiki