Международная группа ученых обнаружила свидетельства эпидемии неизвестного коронавируса или схожего с ним патогена, которая поразила регион Восточной Азии более 20 тысяч лет назад. Генетические следы вспышки до сих пор присутствуют в геномах людей, живущих в этом регионе. Результаты исследования опубликованы в журнале Current Biology.
Узнайте больше в полной версии ➞Исследователи проанализировали данные проекта 1000 Genomes Project, который является крупнейшим общедоступным каталогом общих генетических вариаций человека. Их целью было выяснить, действительно ли древние коронавирусные эпидемии, если такие были, могли как-то повлиять на восприимчивость человека к воздействию вирусов, включая SARS-CoV-2, в настоящее время.
Известно, что естественный отбор в прошлом способствовал распространению в человеческой популяции таких генов, которые кодировали белки, физически взаимодействующие с вирусами (virus-interacting proteins, VIP) и способствовавшие защите от инфекций, уменьшая тяжесть заболеваний. Ученые искали характерные следы такого отбора в 420 белках, взаимодействующими с коронавирусами (CoV-VIP), среди 26 различных человеческих популяций.
Среди всех CoV-VIPов 332 белка взаимодействовали с SARS-CoV-2, а 88 упоминались в научной литературе как связанные с различными коронавирусными инфекциями (SARS-CoV-1, MERS и HCoV-NL63, вызывающий умеренную ОРВИ). Оказалось, что частота таких генов значительно увеличена во многих популяциях Восточной Азии, что не наблюдается у других групп людей. Это указывает на возникновение и других коронавирусных эпидемий в регионе в прошлом.
Так, 42 гена, связанных с коронавирусом, подвергались скоординированному естественному отбору около 25 тысяч лет назад, что соответствует примерно 900 поколениям. Однако исследователи не могут исключить, что причиной отбора мог стать другой неизвестный в настоящее время тип вирусов, который взаимодействовал с человеческими белками так же, как и коронавирусы.
Среди этих 42 CoV-VIPов оказалось много тех вариантов, что влияют на протекание COVID-19 среди современного населения. Мутации, обладающие провирусным или, наоборот, защитными эффектами, затрагивают те фрагменты генов, что находятся рядом с регуляторными областями, активными в легких и других тканях, на которые воздействует SARS-CoV-2. В то же время авторы статьи подчеркивают, что результаты не представляют доказательств каких-либо различий в повышенной или пониженной генетической восприимчивости в какой-либо человеческой популяции.
Все современные коронавирусные вспышки, включая SARS, MERS и COVID-19, происходят из Восточной Азии. Как показывает исследование, этот регион, вероятно, служил естественным резервуаром коронавирусов в течение последних 25 тысяч лет.