Тест-системы, разработанные инновационной биотехнологической компанией «Система-Биотех», которая входит в группу АФК «Система», способны выявить мутантные штаммы коронавируса, в том числе британский штамм и штаммы с другими распространенными мутациями. Об этом говорится в исследовании, проведенном компанией.
Первая тест-система для выявления коронавируса представляет собой набор реагентов для выявления РНК возбудителя коронавирусной инфекции методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени.
Также компанией разработаны два экспресс-теста, основанные на принципе петлевой изотермической амплификации, которые позволяют сократить время реакции до менее чем получаса. Один из этих тестов предназначен для использования в стандартной диагностической лаборатории, а другой является колориметрическим, или цветным, и позволяет определять наличие вируса невооруженным глазом, по изменению цвета жидкости в пробирке, например, прямо у постели больного.
Компьютерный анализ генома SARS-CoV-2 показал, что ген 3CL протеиназы относится к числу генов, наиболее редко затрагиваемых мутациями. Опираясь на эти данные и сведения, которые были собраны по SARS-CoV-2 к марту 2020 года, научные сотрудники «Системы-Биотех» еще при разработке своей первой тест-системы сосредоточились на гене 3CL в качестве мишени для обнаружения вируса и подобрали для этого соответствующие праймеры.
У британского штамма ген 3CL протеиназы тоже не изменен, хотя этот штамм и накопил 23 мутации в других генах. Таким образом, ПЦР-тесты компании «Система-Биотех» позволяют эффективно и с высокой точностью выявлять коронавирусную инфекцию, несмотря на британские мутации.
Также британские мутации не влияют на работу двух других — изотермических экспресс-тестов производства компании «Система-Биотех».
«Выбрав ген 3CL протеиназы для подбора праймеров, наши разработчики изначально заложили в тест-систему большой запас прочности. Заранее изучив мутационный ландшафт родственных вирусов, включая вирус атипичной пневмонии 2003 года, наши научные сотрудники пришли к выводу, что мутации в этом гене, как правило, оказываются для вируса несовместимы с жизнью, поэтому он остается неизменным, и тест-система, нацеленная на него, окажется в выигрыше в условиях продолжительной пандемии. И действительно, из 23 британских мутаций ни одна не ударила по гену 3CL», — рассказала директор по науке компании «Система-Биотех» Наталья Позднякова.